バゴットビル基地は1942年7月、パイロットの訓練と、第二次世界大戦中のアルキャン施設や水力発電所の保護を主な目的として設立された。 サグネーを守れ」というモットーは、この重要な使命を反映したものだった。
終戦後、基地は閉鎖されたが、1951年にヨーロッパのカナダ師団に向かう飛行隊の訓練基地として再開された。 また、1958年にNORADに発展した新カナダ・アメリカ軍の防空作戦でも重要な役割を果たした。
カナダ空軍におけるウィング・コンセプトの導入に伴い、1993年4月1日、第3航空団がバゴットヴィルで再編成された。 この飛行隊は1952年から1968年までツヴァイブリュッケン、1988年から1992年までラールに駐留していた。 その結果、バゴットビル基地は、その波乱に満ちた歴史を通じて、パイロット訓練と防空作戦に不可欠な役割を果たし続けてきた。
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